Teilprojekt 10: AG Braus

Identifizierung differentiell exprimierter Biomarker zur Untersuchung der spezifischen Pathogen/Wirt-Interaktion von Verticillium und Brassicaceen

Der Ascomycet Verticillium longisporum kann sich im Raps-Xylem ausbreiten und ist daher einer der bedeutendsten Schädlinge für den Ertrag dieser Pflanze in Europa. Ziel des hier vorliegenden Projektes ist die Identifikation von Proteinen aus dem Pilzproteom als potentielle Biomarker. Gesucht werden Proteine und die entsprechenden Gene mit veränderter Expression, die entweder während spezifischer Wachstumsphasen in kompatiblen oder bei spezifischer Wachstumsinhibition in inkompatiblen Brassicaceen auftreten. Als Ansatz werden Pilzproteome verglichen. Diese werden mit bzw. ohne angereichertes Wurzelexudat oder Xylemsaft von (in)kompatiblen Pflanzen oder möglichen Komponenten daraus generiert. Zur Klonierung der Gene wird zunächst geprüft, welche auxotrophen Markerstämme sich als Grundlage für die Selektion von transgenen Pilzen von Verticillium longisporum konstruieren lassen. Weiter wird die Effizienz bestimmt, mit der exogene DNA über homologe Rekombination im Pilzgenom verankert werden kann. Potentielle Biomarker sollen als Reporterfusionen in das Genom integriert werden, um so ein geeignetes System zur Identifikation und Erforschung von Pflanzensignalen zu etablieren, auf die der Pilz spezifisch durch veränderte Genexpression reagiert. Dadurch sollen detaillierte Informationen über die systemische Interaktion Verticillium/Brassicaceen gewonnen werden, um das Verständnis der Wechselwirkung Pilz/Pflanze zu vertiefen.