Wir wollen zwei Aspekte der chemischen Wechselwirkung zwischen dem bodenbürtigen Pathogen und seiner Wirtspflanze beleuchten: Die von den beiden Partnern spezifisch während der Infektion gebildeten Sekundärmetaboliten als potentielle Signalstoffe und die Modulierung der Genexpression bei V. longisporum durch Stoffwechselprodukte der Pflanze. Mit Hilfe vergleichender HPLC-MS-Profile infektionsspezifische Metaboliten erfasst. Dabei werden potentielle Virulenzfaktoren von V. longisporum erstmals direkt in der Pflanze identifiziert.

Gleichzeitig wird die Wirkung pflanzlicher Metaboliten auf die Genexpression bei V. longisporum untersucht. Um differentiell exprimierte Gene zu identifizieren sollen cDNA-AFLP- Transkriptsätze (TDF's) aus in vitro Kulturen von V. longisporum, die mit authentischen Xylemsaft-Extrakten aus Raps behandelt werden, mit unbehandelten Pilzkulturen verglichen werden. Dazu wird eine weiterentwickelte, quantitative Variante von cDNA-AFLP eingesetzt. Mögliche pathogenitäts- relevante Gene sollen durch weiterführende molekularbiologische und chemische Methoden in ihrer Funktion charakterisiert werden.

Die Integration von chemisch-analytischen Daten mit Sequenzdaten aus der cDNA-AFLP Analyse und mit den Detoxifizierungsaktivitäten des Pilzes soll unser Verständnis der Biologie von bodenbürtigen, xylembesiedelnden phytopathogenen Pilzen vertiefen